Мне кажется, разница очевидна. Если человек является сотрудником страховой компании, в которой он получает зарплату, то вполне логично предположить, что в первую очередь он будет защищать интересы этой фирмы и постарается минимизировать её расходы. Конечно, хочется надеяться, что большинство компаний отличаются добросовестностью и заботятся о перспективах развития и собственной репутации. Разумеется, никто не станет в открытую ущемлять права страхователя на получение компенсации. Но ведь аварийный комиссар — человек юридически грамотный, разбирающийся в таких тонкостях, которые попавшему в ДТП гражданину невдомёк. Именно поэтому многие автовладельцы не склонны всецело доверять аварийным комиссарам, работающим при страховых компаниях. Безусловно, независимая служба — это тоже коммерческое предприятие. Но средства на его содержание поступают не от страховой фирмы, а непосредственно от автовладельцев, которые оплачивают ее услуги. Ну а кто платит, тот, как известно, и музыку заказывает. Поэтому независимая служба аварийных комиссаров работает исключительно в интересах своих клиентов. Хотя  сейчас многие страховые компании, заботясь о своей репутации, заключают договора с независимыми АК и оплачивают их услуги сами.